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引物（Primer）在聚合作用的起始時(shí)，可以刺激合成另一種大分子，并與反應物以共價(jià)鍵形式連接的序列。在核酸化學(xué)中，引物是一段短的單鏈RNA或DNA片段，可結合在核酸鏈上與之互補的區域，其功能是作為核苷酸聚合作用的起始點(diǎn)，核酸聚合酶可由其3′端開(kāi)始合成新的核酸鏈。體外人工設計的引物被廣泛用于聚合酶鏈反應、測序和探針合成等。

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自然中存在有生物的DNA復制引物（RNA引物）和聚合酶鏈式反應（PCR）中人工合成的引物（通常為DNA引物）。一般所說(shuō)引物，指DNA引物，以下簡(jiǎn)稱(chēng)引物。

引物（Primer）在聚合作用的起始時(shí)，可以刺激合成另一種大分子，并與反應物以共價(jià)鍵形式連接的序列。在核酸化學(xué)中，引物是一段短的單鏈RNA或DNA片段，可結合在核酸鏈上與之互補的區域，其功能是作為核苷酸聚合作用的起始點(diǎn)，核酸聚合酶可由其3′端開(kāi)始合成新的核酸鏈。體外人工設計的引物被廣泛用于聚合酶鏈反應、測序和探針合成等。

5'GCTACGTTCTTCATCGAT3'
自然中存在有生物的DNA復制引物（RNA引物）和聚合酶鏈式反應（PCR）中人工合成的引物（通常為DNA引物）。一般所說(shuō)引物，指DNA引物，以下簡(jiǎn)稱(chēng)引物。

上游引物：DNA分子兩端不一樣，因為核苷酸分子不是對稱(chēng)的，5'位有個(gè)磷酸，3'位是-OH就是：磷酸端和羥基端。DNA復制總是從5’端到3’端，因為DNA聚合酶只能往3’端加核苷酸。所以誰(shuí)先復制誰(shuí)上游，往后的就是下游，上游下游是個(gè)相對概念，是某一個(gè)序列/堿基相對于另一個(gè)序列/堿基而言。上游引物是靠近5'端的，下游引物是靠近3‘端的。

DNA是雙鏈，兩個(gè)鏈是反向平行的，DNA聚合酶順著(zhù)其中一個(gè)鏈走，這個(gè)鏈就是負鏈，另一個(gè)鏈是反著(zhù)一段一段復制的，這個(gè)是正鏈。

正義鏈（sensestrand）是上游引物，反義鏈（antisensestrand）是下游引物，鏈的合成方向是從5‘~3’。上游引物又叫正向引物,下游引物叫反向引物，在設計引物的時(shí)候一般是以其中的一條鏈來(lái)設的,所以上游引物是與這條鏈相同的，而反向引物則要反向互補后才行。

上下游引物長(cháng)度可以不同，主要是兩條引物的Tm值要接近不然會(huì )降低擴增效率PCR擴增并不要求上下游引物一定要相同長(cháng)度。但是，如果上下游引物長(cháng)度相差太遠，并不利于擴增反應的進(jìn)行。這一點(diǎn)可以從primer5.0中的引物評分可以看出來(lái)。因此，除非迫不得已，建議將兩條引物長(cháng)度設計的相近，這樣引物評分要高一些。也有利于擴增反應的進(jìn)行。

引物（Primer）在聚合作用的起始時(shí)，可以刺激合成另一種大分子，并與反應物以共價(jià)鍵形式連接的序列。在核酸化學(xué)中，引物是一段短的單鏈RNA或DNA片段，可結合在核酸鏈上與之互補的區域，其功能是作為核苷酸聚合作用的起始點(diǎn)，核酸聚合酶可由其3′端開(kāi)始合成新的核酸鏈。體外人工設計的引物被廣泛用于聚合酶鏈反應、測序和探針合成等。

自然中存在有生物的DNA復制引物（RNA引物）和聚合酶鏈式反應（PCR）中人工合成的引物（通常為DNA引物）。一般所說(shuō)引物，指DNA引物，以下簡(jiǎn)稱(chēng)引物。

上游引物：DNA分子兩端不一樣，因為核苷酸分子不是對稱(chēng)的，5'位有個(gè)磷酸，3'位是-OH就是：磷酸端和羥基端。DNA復制總是從5’端到3’端，因為DNA聚合酶只能往3’端加核苷酸。所以誰(shuí)先復制誰(shuí)上游，往后的就是下游，上游下游是個(gè)相對概念，是某一個(gè)序列/堿基相對于另一個(gè)序列/堿基而言。上游引物是靠近5'端的，下游引物是靠近3‘端的。

DNA是雙鏈，兩個(gè)鏈是反向平行的，DNA聚合酶順著(zhù)其中一個(gè)鏈走，這個(gè)鏈就是負鏈，另一個(gè)鏈是反著(zhù)一段一段復制的，這個(gè)是正鏈。

正義鏈（sensestrand）是上游引物，反義鏈（antisensestrand）是下游引物，鏈的合成方向是從5‘~3’。上游引物又叫正向引物,下游引物叫反向引物，在設計引物的時(shí)候一般是以其中的一條鏈來(lái)設的,所以上游引物是與這條鏈相同的，而反向引物則要反向互補后才行。

上下游引物長(cháng)度可以不同，主要是兩條引物的Tm值要接近不然會(huì )降低擴增效率PCR擴增并不要求上下游引物一定要相同長(cháng)度。但是，如果上下游引物長(cháng)度相差太遠，并不利于擴增反應的進(jìn)行。這一點(diǎn)可以從primer5.0中的引物評分可以看出來(lái)。因此，除非迫不得已，建議將兩條引物長(cháng)度設計的相近，這樣引物評分要高一些。也有利于擴增反應的進(jìn)行。

上游引物：DNA分子兩端不一樣，因為核苷酸分子不是對稱(chēng)的，5'位有個(gè)磷酸，3'位是-OH就是：磷酸端和羥基端。DNA復制總是從5’端到3’端，因為DNA聚合酶只能往3’端加核苷酸。所以誰(shuí)先復制誰(shuí)上游，往后的就是下游，上游下游是個(gè)相對概念，是某一個(gè)序列/堿基相對于另一個(gè)序列/堿基而言。上游引物是靠近5'端的，下游引物是靠近3‘端的。

DNA是雙鏈，兩個(gè)鏈是反向平行的，DNA聚合酶順著(zhù)其中一個(gè)鏈走，這個(gè)鏈就是負鏈，另一個(gè)鏈是反著(zhù)一段一段復制的，這個(gè)是正鏈。

正義鏈（sensestrand）是上游引物，反義鏈（antisensestrand）是下游引物，鏈的合成方向是從5‘~3’。上游引物又叫正向引物,下游引物叫反向引物，在設計引物的時(shí)候一般是以其中的一條鏈來(lái)設的,所以上游引物是與這條鏈相同的，而反向引物則要反向互補后才行。

上下游引物長(cháng)度可以不同，主要是兩條引物的Tm值要接近不然會(huì )降低擴增效率PCR擴增并不要求上下游引物一定要相同長(cháng)度。但是，如果上下游引物長(cháng)度相差太遠，并不利于擴增反應的進(jìn)行。這一點(diǎn)可以從primer5.0中的引物評分可以看出來(lái)。因此，除非迫不得已，建議將兩條引物長(cháng)度設計的相近，這樣引物評分要高一些。也有利于擴增反應的進(jìn)行。